作為一個(gè)安全的edi報關(guān)系統，一是必須具有一個(gè)安全、可靠的通信網(wǎng)絡(luò )，以保證報關(guān)信息安全、快速、準確地傳遞；　
第二是必須保證數據庫服務(wù)器絕對安全，防止黑客闖入網(wǎng)絡(luò )盜取、篡改和破壞信息?！?br>第三，是電子報關(guān)數據和電子簽名的法律效力問(wèn)題。電子數據報關(guān)單上沒(méi)有申報單位的印鑒和報關(guān)員的簽名，只有電子簽名。從海關(guān)的電腦打印出來(lái)的電子數據報關(guān)單及其有關(guān)報關(guān)單證能否直接作為證據?通關(guān)作業(yè)改革實(shí)施后，在電子報關(guān)單和紙質(zhì)報關(guān)單并存的情況下，出現兩者內容不一致，應以哪種單證為有效單證?另外，由于電子數據的易消失性(如在操作時(shí)指令失當或染上電腦病毒，均會(huì )導致電子數據的部分或全部消失)和易改動(dòng)性，主觀(guān)上或客觀(guān)上容易造成edi用戶(hù)與海關(guān)計算機記載的內容不一致，這時(shí)應以哪方計算機的儲存內容為準?如何認定當事人申報不實(shí)或偽報、瞞報的法律責任等等。